TMS wykorzystuje silne pole magnetyczne o krótkim czasie trwania impulsu, które przenika tkanki oraz kości czaszki, stymulując głębokie ośrodki nerwowe. Wystarczy zlokalizować motoryczne potencjały wywołane (MEP), a następnie ustawić cewkę i rozpocząć sesję.
Technika TMS znalazła szerokie zastosowanie w diagnostyce neurologicznej oraz w badaniach nad różnymi funkcjami neuropsychologicznymi. TAMAS wykorzystywany jest także w terapii psychiatrycznej.

